处理专利合同纠纷的方法有协商和诉讼。如果未经许可实施专利，即侵犯专利权，引起纠纷，当事人应协商解决。如果无法协商，则专利权人或利益相关者可以向提起诉讼。
法律分析
专利合同纠纷案的处理方法有：协商处理和诉讼处理。如果未经专利权人许可实施其专利，即属于侵犯其专利权，并引起了纠纷，当事人应通过协商解决。如果专利纠纷当事人不愿意协商或者协商不成，专利权人或利害关系人可以向人民提起诉讼。
法律依据
《民事诉讼法》第二十三条
因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民管辖。 该内容由 梁万龙律师 和 家和律云 共创回答
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